Permanecen a la espera de la llegada de un barco chino que debe introducirles, clandestinamente, en el continente. Francisco Javier estaba en una choza acompañado de su fiel amigo de origen chino Antonio de Santa Fe. Pero por las condiciones de pobreza y el gélido viento frío que azotaba la isla, Francisco se enfermó de pulmonía, por o cual le dio fiebre por lo que deliraba diciendo: "Madre de Dios, ten misericordia de mí", "Jesús, Hijo de David, ten misericordia de mí". Antonio lo cuidó esa noche de viernes y al amanecer del sábado "se durmió en el Señor", el 3 de diciembre de 1552, muere Francisco Javier cuando contaba 46 años de edad.4